Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Hoxc9P09633 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hoxc9P09633 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms