Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxc8P09025 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc8P09025 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms