Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxb7P09024 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb7P09024 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms