Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NefmP08553 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NefmP08553 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NefmP08553 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NefmP08553 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NefmP08553 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NefmP08553 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NefmP08553 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NefmP08553 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NefmP08553 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NefmP08553 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NefmP08553 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NefmP08553 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NefmP08553 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NefmP08553 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NefmP08553 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NefmP08553 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NefmP08553 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NefmP08553 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NefmP08553 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NefmP08553 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NefmP08553 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NefmP08553 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NefmP08553 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NefmP08553 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NefmP08553 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NefmP08553 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NefmP08553 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NefmP08553 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NefmP08553 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NefmP08553 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NefmP08553 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NefmP08553 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NefmP08553 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NefmP08553 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NefmP08553 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NefmP08553 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NefmP08553 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NefmP08553 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NefmP08553 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NefmP08553 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NefmP08553 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NefmP08553 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NefmP08553 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NefmP08553 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NefmP08553 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NefmP08553 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NefmP08553 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NefmP08553 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NefmP08553 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NefmP08553 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NefmP08553 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NefmP08553 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NefmP08553 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NefmP08553 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NefmP08553 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NefmP08553 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NefmP08553 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NefmP08553 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NefmP08553 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NefmP08553 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NefmP08553 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NefmP08553 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NefmP08553 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NefmP08553 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NefmP08553 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NefmP08553 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NefmP08553 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NefmP08553 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NefmP08553 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NefmP08553 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NefmP08553 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NefmP08553 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NefmP08553 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NefmP08553 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NefmP08553 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NefmP08553 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NefmP08553 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NefmP08553 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NefmP08553 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NefmP08553 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NefmP08553 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NefmP08553 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NefmP08553 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NefmP08553 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms