Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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PtprcP06800 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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PtprcP06800 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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PtprcP06800 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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PtprcP06800 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprcP06800 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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PtprcP06800 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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PtprcP06800 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprcP06800 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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PtprcP06800 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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PtprcP06800 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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PtprcP06800 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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PtprcP06800 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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PtprcP06800 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprcP06800 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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PtprcP06800 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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PtprcP06800 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprcP06800 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprcP06800 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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PtprcP06800 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprcP06800 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprcP06800 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprcP06800 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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