Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh1P04444 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh1P04444 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms