Protein–RNA interactions for Protein: P02831

Hoxa3, Homeobox protein Hox-A3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa3P02831 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa3P02831 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms