Protein–RNA interactions for Protein: P01897

H2-L, H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-LP01897 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-LP01897 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-LP01897 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-LP01897 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-LP01897 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-LP01897 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-LP01897 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-LP01897 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-LP01897 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-LP01897 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-LP01897 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms