Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01659 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01659 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01659 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01659 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01659 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01659 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01659 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01659 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01659 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01659 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01659 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01659 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01659 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01659 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01659 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01659 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01659 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01659 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01659 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01659 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01659 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01659 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01659 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01659 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01659 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01659 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01659 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01659 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01659 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01659 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01659 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01659 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01659 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01659 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01659 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01659 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01659 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01659 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01659 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01659 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01659 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01659 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01659 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01659 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01659 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01659 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01659 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01659 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01659 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01659 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01659 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01659 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01659 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01659 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01659 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01659 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01659 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01659 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01659 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01659 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01659 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01659 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01659 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01659 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01659 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01659 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01659 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01659 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01659 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01659 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01659 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01659 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms