Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp8O89110 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp8O89110 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp8O89110 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp8O89110 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Casp8O89110 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms