Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops6O88545 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cops6O88545 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cops6O88545 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops6O88545 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops6O88545 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops6O88545 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops6O88545 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops6O88545 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops6O88545 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops6O88545 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops6O88545 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops6O88545 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms