Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnnal1O88327 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnal1O88327 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnal1O88327 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms