Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec11aO88200 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec11aO88200 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms