Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly86O88188 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly86O88188 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly86O88188 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly86O88188 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly86O88188 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly86O88188 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly86O88188 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms