Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma3O70435 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma3O70435 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma3O70435 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma3O70435 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma3O70435 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma3O70435 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma3O70435 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms