Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nptx2O70340 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nptx2O70340 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nptx2O70340 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms