Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lnx1O70263 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lnx1O70263 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms