Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf5O70191 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf5O70191 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf5O70191 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf5O70191 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf5O70191 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf5O70191 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf5O70191 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf5O70191 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf5O70191 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf5O70191 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf5O70191 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atf5O70191 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms