Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap2O55126 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms