Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg2O55111 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg2O55111 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms