Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Syngr2O55101 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms