Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn20O55082 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn20O55082 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn20O55082 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn20O55082 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn20O55082 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn20O55082 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptpn20O55082 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptpn20O55082 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn20O55082 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms