Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb2O55029 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb2O55029 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb2O55029 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb2O55029 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb2O55029 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb2O55029 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb2O55029 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copb2O55029 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb2O55029 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms