Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pole2O54956 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole2O54956 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole2O54956 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole2O54956 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole2O54956 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole2O54956 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pole2O54956 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pole2O54956 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole2O54956 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms