Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema6bO54951 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms