Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf12O54907 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms