Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limk2O54785 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limk2O54785 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limk2O54785 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limk2O54785 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Limk2O54785 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms