Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SpibO35906 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SpibO35906 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SpibO35906 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SpibO35906 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SpibO35906 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SpibO35906 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SpibO35906 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SpibO35906 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SpibO35906 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SpibO35906 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SpibO35906 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SpibO35906 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SpibO35906 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SpibO35906 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpibO35906 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpibO35906 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpibO35906 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpibO35906 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpibO35906 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpibO35906 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpibO35906 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpibO35906 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpibO35906 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpibO35906 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpibO35906 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpibO35906 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpibO35906 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpibO35906 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpibO35906 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpibO35906 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpibO35906 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpibO35906 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpibO35906 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SpibO35906 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpibO35906 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SpibO35906 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SpibO35906 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SpibO35906 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SpibO35906 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SpibO35906 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SpibO35906 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SpibO35906 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SpibO35906 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpibO35906 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpibO35906 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpibO35906 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpibO35906 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpibO35906 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpibO35906 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpibO35906 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpibO35906 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpibO35906 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpibO35906 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpibO35906 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpibO35906 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SpibO35906 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpibO35906 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpibO35906 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpibO35906 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpibO35906 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpibO35906 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpibO35906 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpibO35906 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpibO35906 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpibO35906 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SpibO35906 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpibO35906 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpibO35906 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SpibO35906 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SpibO35906 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpibO35906 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpibO35906 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpibO35906 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpibO35906 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpibO35906 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpibO35906 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SpibO35906 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpibO35906 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpibO35906 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SpibO35906 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpibO35906 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpibO35906 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpibO35906 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpibO35906 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SpibO35906 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SpibO35906 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SpibO35906 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SpibO35906 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SpibO35906 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SpibO35906 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SpibO35906 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SpibO35906 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SpibO35906 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpibO35906 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpibO35906 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpibO35906 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpibO35906 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpibO35906 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpibO35906 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms