Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NudcO35685 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NudcO35685 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NudcO35685 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NudcO35685 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NudcO35685 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NudcO35685 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NudcO35685 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NudcO35685 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NudcO35685 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NudcO35685 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NudcO35685 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NudcO35685 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NudcO35685 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NudcO35685 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NudcO35685 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NudcO35685 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NudcO35685 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NudcO35685 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NudcO35685 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NudcO35685 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NudcO35685 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NudcO35685 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NudcO35685 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NudcO35685 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NudcO35685 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NudcO35685 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NudcO35685 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NudcO35685 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NudcO35685 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NudcO35685 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NudcO35685 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NudcO35685 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NudcO35685 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NudcO35685 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NudcO35685 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NudcO35685 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NudcO35685 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NudcO35685 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NudcO35685 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NudcO35685 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NudcO35685 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NudcO35685 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NudcO35685 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NudcO35685 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NudcO35685 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NudcO35685 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NudcO35685 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NudcO35685 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NudcO35685 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NudcO35685 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NudcO35685 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NudcO35685 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NudcO35685 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NudcO35685 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NudcO35685 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NudcO35685 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NudcO35685 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NudcO35685 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NudcO35685 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NudcO35685 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NudcO35685 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NudcO35685 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NudcO35685 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NudcO35685 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NudcO35685 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NudcO35685 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NudcO35685 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NudcO35685 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NudcO35685 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NudcO35685 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NudcO35685 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NudcO35685 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NudcO35685 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NudcO35685 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NudcO35685 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NudcO35685 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NudcO35685 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NudcO35685 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NudcO35685 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NudcO35685 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NudcO35685 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NudcO35685 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NudcO35685 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NudcO35685 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NudcO35685 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NudcO35685 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NudcO35685 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NudcO35685 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NudcO35685 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NudcO35685 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NudcO35685 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NudcO35685 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NudcO35685 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NudcO35685 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NudcO35685 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NudcO35685 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NudcO35685 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NudcO35685 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NudcO35685 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms