Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag2O35638 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag2O35638 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag2O35638 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag2O35638 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms