Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc16a8O35308 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc16a8O35308 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Slc16a8O35308 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc16a8O35308 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc16a8O35308 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc16a8O35308 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc16a8O35308 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc16a8O35308 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc16a8O35308 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc16a8O35308 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc16a8O35308 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc16a8O35308 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc16a8O35308 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc16a8O35308 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc16a8O35308 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms