Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn9O35239 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ptpn9O35239 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn9O35239 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Ptpn9O35239 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn9O35239 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn9O35239 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn9O35239 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn9O35239 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Ptpn9O35239 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn9O35239 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Ptpn9O35239 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn9O35239 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Ptpn9O35239 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Ptpn9O35239 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn9O35239 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn9O35239 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn9O35239 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Ptpn9O35239 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Ptpn9O35239 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Ptpn9O35239 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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