Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe40O35185 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe40O35185 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe40O35185 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe40O35185 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe40O35185 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe40O35185 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe40O35185 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe40O35185 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe40O35185 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe40O35185 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms