Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc23O35125 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc23O35125 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms