Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Q1O19441 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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H2-Q1O19441 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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H2-Q1O19441 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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H2-Q1O19441 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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H2-Q1O19441 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms