Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp2O08999 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp2O08999 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp2O08999 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp2O08999 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ltbp2O08999 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltbp2O08999 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms