Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfra2O08842 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfra2O08842 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms