Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dctn1O08788 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dctn1O08788 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms