Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfil3O08750 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms