Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf6O08584 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf6O08584 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf6O08584 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf6O08584 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf6O08584 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf6O08584 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf6O08584 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf6O08584 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms