Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
U90926O08546 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
U90926O08546 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
U90926O08546 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
U90926O08546 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
U90926O08546 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
U90926O08546 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
U90926O08546 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
U90926O08546 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
U90926O08546 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
U90926O08546 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
U90926O08546 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
U90926O08546 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
U90926O08546 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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U90926O08546 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
U90926O08546 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
U90926O08546 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
U90926O08546 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
U90926O08546 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
U90926O08546 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
U90926O08546 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
U90926O08546 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
U90926O08546 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
U90926O08546 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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U90926O08546 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
U90926O08546 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
U90926O08546 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
U90926O08546 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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U90926O08546 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
U90926O08546 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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U90926O08546 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
U90926O08546 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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U90926O08546 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
U90926O08546 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
U90926O08546 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
U90926O08546 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
U90926O08546 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
U90926O08546 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
U90926O08546 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
U90926O08546 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
U90926O08546 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
U90926O08546 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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