Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsmbO08540 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsmbO08540 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsmbO08540 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MsmbO08540 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MsmbO08540 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsmbO08540 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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