Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20878L7N244 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20878L7N244 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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