Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Ccdc180J3QNE4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ccdc180J3QNE4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc180J3QNE4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms