Protein–RNA interactions for Protein: J3QME2

Gm20914, Predicted gene, 20914, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20914J3QME2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20914J3QME2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm20914J3QME2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm20914J3QME2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20914J3QME2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20914J3QME2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms