Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm21818J3KMS6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm21818J3KMS6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm21818J3KMS6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm21818J3KMS6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm21818J3KMS6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21818J3KMS6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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