Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp2b1G5E829 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp2b1G5E829 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b1G5E829 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms