Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r34G3XA52 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms