Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc9a3G3X939 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms