Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmigd3G3X8R9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms